不纯净的气体作载气，可导致气相色谱仪柱失效，样品变化，氢焰色谱可导致基流噪音增大，热导色谱可导致鉴定器线性变劣等，所以气相色谱仪载气**经过净化。例如载气中如果含有杂质，可能会污染系统，或在系统中沉积，影响仪器寿命，同时气相色谱仪还可能产生鬼峰，所以高纯的载气可以避免气相色谱仪的故障。